Лечение эндоцервицита традиционно осуществляется в два этапа. Для начала устраняется возбудителя инфекции, с этой целью подбирается антибиотик, способный воздействовать на конкретного возбудителя. После избавления от инфекции следует восстановить нормальную микрофлору влагалища для снижения риска возможного рецидива. Необходимо учитывать, что успешная терапия возможна только если будут ликвидированы все другие воспалительные гинекологические недуги.